O Núcleo de Cooperativas da Ajorpeme é formado pelas seguintes cooperativas: Acredicoop, Cooepe, Coopercargo, Coopertupy, Credcrea, Sicoob Credisc, Sicoob Multicredi, Sicoob São Miguel, Sicredi, Transpocred, Unicred, Unimed e Uniodonto.

Uma das novidades da Ajorpeme é o Núcleo de Cooperativas, iniciativa inédita entre as entidades de classe do Norte catarinense. O núcleo, que reúne 13 cooperativas de cinco segmentos diferentes (Crédito, Educação, Transporte, Consumo e Saúde), tem como uma das primeiras atribuições promover a integração e o fortalecimento das cooperativas do litoral norte catarinense e tem como primeiro objetivo, produzir e divulgar ainda no primeiro semestre do ano, um relatório com os principais números das cooperativas que compõem o núcleo, para destacar o potencial e os benefícios que o cooperativismo pode oferecer à sociedade. 

"A comunidade de uma forma geral está procurando alternativas com melhor custo-benefício em todos os segmentos de negócios e o cooperativismo tem muito a oferecer para o desenvolvimento econômico e social nos municípios", destaca o presidente do Núcleo de Cooperativas e diretor Executivo da Acredicoop - Cooperativa de Crédito, Ivan Roberto de Borba. Ele lembra que a "intercooperação" entre as diversas cooperativas (Sexto Princípio do cooperativismo) é um dos motivos principais para criação deste núcleo. Os outros seis princípios são: 1. Adesão Voluntária e Livre; 2. Gestão Democrática; 3. Participação Econômica dos Membros; 4. Autonomia e Independência; 5. Educação, Formação e Informação e 7. Interesse pela Comunidade.